Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ABCE1P61221 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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