Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms