Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCKAP1LP55160 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms