Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms