Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms