Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms