Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCA5LO95447 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms