Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms