Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 326.5 ms