Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8JA6NMD2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms