Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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