Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms