Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
AGAP1Q9UPQ3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms