Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms