Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms