Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms