Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP13Q92995 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms