Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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