Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms