Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms