Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ICOS-201ENST00000316386 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF304-204ENST00000598744 3331 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ASB15-202ENST00000434204 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 KCNA10-201ENST00000369771 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.58-201ENST00000618720 282 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TLE4-201ENST00000265284 2382 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SCNN1A-203ENST00000360168 3481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HTR3B-201ENST00000260191 2011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms