Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms