Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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