Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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