Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RFTN1Q14699 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RFTN1Q14699 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RFTN1Q14699 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RFTN1Q14699 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RFTN1Q14699 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RFTN1Q14699 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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