Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms