Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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