Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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