Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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