Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM28Q13263 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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