Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SRSF5Q13243 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SRSF5Q13243 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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