Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms