Protein–RNA interactions for Protein: Q12912

LRMP, Lymphoid-restricted membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMPQ12912 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRMPQ12912 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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