Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms