Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms