Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNC1Q01954 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms