Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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CENPFP49454 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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CENPFP49454 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CENPFP49454 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CENPFP49454 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPFP49454 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CENPFP49454 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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