Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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