Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP2P32456 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBP2P32456 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBP2P32456 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBP2P32456 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBP2P32456 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBP2P32456 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBP2P32456 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBP2P32456 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBP2P32456 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP2P32456 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBP2P32456 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms