Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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