Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM5AP29375 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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