Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms