Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms