Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms