Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms