Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FARP2O94887 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FARP2O94887 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FARP2O94887 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms