Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TO15178 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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