Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
V9GY48 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
V9GY48 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
V9GY48 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
V9GY48 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
V9GY48 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
V9GY48 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
V9GY48 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
V9GY48 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
V9GY48 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
V9GY48 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
V9GY48 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
V9GY48 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
V9GY48 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
V9GY48 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
V9GY48 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
V9GY48 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
V9GY48 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
V9GY48 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
V9GY48 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
V9GY48 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
V9GY48 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
V9GY48 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
V9GY48 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
V9GY48 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
V9GY48 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
V9GY48 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
V9GY48 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
V9GY48 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
V9GY48 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
V9GY48 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
V9GY48 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
V9GY48 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
V9GY48 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
V9GY48 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
V9GY48 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
V9GY48 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
V9GY48 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
V9GY48 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
V9GY48 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
V9GY48 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
V9GY48 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
V9GY48 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
V9GY48 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
V9GY48 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
V9GY48 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
V9GY48 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
V9GY48 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
V9GY48 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
V9GY48 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
V9GY48 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
V9GY48 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
V9GY48 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
V9GY48 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
V9GY48 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
V9GY48 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
V9GY48 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
V9GY48 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
V9GY48 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
V9GY48 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
V9GY48 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
V9GY48 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
V9GY48 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
V9GY48 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
V9GY48 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
V9GY48 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
V9GY48 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
V9GY48 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
V9GY48 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
V9GY48 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
V9GY48 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
V9GY48 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
V9GY48 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
V9GY48 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
V9GY48 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
V9GY48 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
V9GY48 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
V9GY48 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
V9GY48 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
V9GY48 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
V9GY48 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
V9GY48 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
V9GY48 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
V9GY48 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
V9GY48 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
V9GY48 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
V9GY48 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
V9GY48 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms