Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms