Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED7Q9Y3B3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms